レーシックの安全性は広く認められていますが、合併症がまったくないとは言えません。
一般的な合併症としては、手術後、「視界がぼやける」「異物感」「ドライアイ」などがありますが、多くの場合、数週間から数カ月解消します。ただし、個人差があり、中には長く続く場合もあります。
重度の合併症としては、まれですが、「調節力の低下」「夜間や暗いところでの視力の低下」「角膜の混濁」「光を敏感に感じる」「フラップの不良」など起こる場合があります。比較的治療に時間がかかるし、再治療になることもあります。合併症の中には、医師の技術不足が原因で起こるものもあります。